< Asien
John Sheppard i Afghanistan.
Afghanistan är ett land i Centralasien, jorden. Överste John Sheppard deltog i flera verksamheter där någon gång innan du tar del i Atlantis Expeditionen. Under sin tid där, han förlorade flera av sina vänner inom flygvapnet, bland annat Lyle Holland, Dex och Mitch. (ATL: "Home", "Phantoms")
Alternativ verklighet[]
I en alternativ verklighet, John Sheppard likaså tjänstgjorde i Afghanistan. Men han var dishonorably ut efter att försöka rädda en icke namngiven läkare, med vilken han var romantiskt involverade. Hans helikopter sköts ner och kraschen dödades fyra amerikanska soldater och åtta civilpersoner. Efter snävt flyr fängelse av politiska skäl, flyttade han till Las Vegas där han gick med i Las Vegas Polisen. (ATL: "Vegas")